A AS-PTA surgiu no contexto do lento processo de redemocratização do país, nos anos 80, quando começaram a se reorganizar os movimentos sociais no campo. A entidade foi criada em 1983 como um projeto anexo à ONG Fase, o Projeto Tecnologias Alternativas. Em 1990, se constituiu como entidade com personalidade jurídica própria. O intenso processo de expropriação econômica e de migrações verificado na década de 70 como conseqüência da modernização capitalista da agricultura colocou então para os movimentos sociais do campo uma dupla necessidade: recompor suas estruturas organizativas e, ao mesmo tempo, promover ações visando ao fortalecimento da capacidade produtiva da agricultura familiar de forma assegurar melhores condições de permanência e resistência na terra. Para os sem-terra, tratava-se de incorporar tecnologias inovadoras de produção viáveis nas condições adversas em que se davam as primeiras ocupações dos latifúndios improdutivos em todo o país.Nesse contexto, surge o embrião da AS-PTA como resultado da parceria entre a Comissão Pastoral da Terra (CPT), movimentos sociais de expressão regional no campo e um grupo de técnicos visando a equacionar meios para enfrentar os desafios acima colocados. Para tanto, foi constituído um núcleo de coordenação e equipes locais em vários estados da Federação que se articularam a ONGs, constituindo a então denominada Rede Tecnologias Alternativas. Constituída originalmente como a coordenação política dessa Rede, a partir de 1990, de forma simultânea com sua instituição jurídica, a entidade assumiu a configuração até hoje vigente e o objetivo estratégico de atuar na promoção da agricultura familiar e da agroecologia no plano nacional. A partir de 1993, incorporou à sua estratégia os programas de Desenvolvimento Local do Agreste da Paraíba e do Centro-Sul do Paraná que passaram a se constituir como espaços para a geração de referências técnicas e metodológicas, subsidiando a intervenção social e política da AS-PTA no plano nacional. Em 1999 deu início ao Projeto Agricultura Urbana no Rio de Janeiro atribuindo a ele a mesma vocação que os Programas Locais.